长江设计集团作为湖北省首批创新型企业和国家高新技术企业，近年来以打造研究型企业集团为目标，持续构建科研与生产融合的新型管理体系，构建多层级创新平台，取得了一大批国际领先的重大科技成果，在引领企业高质量发展、高水平服务国家战略、重点工程和水利行业取得了显著成效，走出了一条“勘测设计、科技研发、高端智库”三大功能为一体的综合型高科技企业发展之路。
拥有国家大坝安全工程技术研究中心、博士后科研工作站、水利部长江治理与保护重点实验室、流域水安全湖北省重点实验室、湖北省长江流域水环境综合治理工程技术研究中心、生态水道技术湖北省工程研究中心、河湖光热资源综合利用湖北省工程研究中心、城市智慧管网湖北省工程研究中心、湖北省水利信息感知与大数据工程技术研究中心、湖北省大坝安全诊断及加固工程技术研究中心、长江水利委员会互联网+智慧水利重点实验室、水利标准国际化与流域管理标准化研究中心重点实验室等十多个高端研发平台。获批水利部科技推广中心长江物探检测技术推广示范基地和3个院士专家工作站。实行科研平台逐级培育和实体化（专业化）运行机制，开展技术攻关、技术集成、产品研发的全链条创新，促进技术产品化与工程化。目前，集团有6家子公司取得国家高新技术企业资格认证。
充分发挥技术平台优势和人才优势，长江设计集团多方位参与国家重大科研项目，为国家智力和决策支持做出了重大贡献。截止目前，主持或参与了国家和省部级科技计划课题200余项。其中牵头“重大水利枢纽通航建筑物建设与提升技术”“长距离调水工程建设与安全运行集成研究及应用”“长江上游梯级水库群多目标联合调度技术”“南水北调工程应急抢险和快速修复关键技术与装备研究”“洞庭湖与鄱阳湖多目标调控关键技术”等国家重点研发计划项目11项，国家重点研发课题32项，参与国家重点研发课题63项。 “南水北调中线工程膨胀土和高填方渠道建设关键技术研究与示范”等43项国家科技支撑计划课题（专题）、“三峡水库水资源综合利用调度研究”等50余项省部级科技计划项目已通过验收。
立足自主创新与研发，以总收入的3%~5%投入科技创新研发活动，年均投入近2亿元。技术创新服务生产经营能力不断提升。围绕水利水电工程勘测、水资源综合利用、河道治理与利用、水利水电工程设计、高坝通航、生态与环境?；?、病险工程治理、市政交通、新能源、信息技术应用等领域，广泛开展生产实践和技术攻关，已形成了高坝水工技术、大型跨流域调水工程技术、超大容量水轮发电机组技术、流域大型骨干水库调度与流域梯级联合调度技术、高坝通航船闸与升船机技术、水生态环境与工程技术、复杂地质条件下的综合勘察技术、病险工程综合治理技术、水利水电工程空间信息感知应用技术、移民工程与数字化技术、城市地下空间利用技术、水利信息化、地下核电、水面光伏等众多技术品牌，部分科技成果水平已处于国内领先甚至国际领先水平。
通过艰苦不懈的长期努力和科学研究，长江设计集团形成了一大批包含科技奖励、自主知识产权、规程规范在内的科技成果，已成为企业参与市场竞争的核心竞争力和品牌优势。荣获2项国家科技进步特等奖，8项国际FIDIC工程项目奖，3项国际大坝里程碑奖，12项国家科技进步一、二等奖，1项国家技术发明二等奖、7项全国优秀工程勘察设计金奖，共获得省部级以上科技奖励740余项。
高度重视技术创新和专利?；すぷ?专利申报总量和专利授权总量稳步增长。目前拥有核心自主知识产权（专利和软件著作权）1200项，其中有效发明专利228项。承担国家、行业标准编制140余项，其中国家标准20项，累计发布企业标准50余项。